Les deux enquêtes relatives au Charles de Gaulle seront conduites de façon distincte : l'enquête de commandement sera effectuée conjointement par l'inspection de la marine et le service de santé des armées, l'étude épidémiologique par des experts du centre d'épidémiologie et de santé publique des armées (CESPA).
Les personnels de santé des armées, de même que les personnels civils et militaires du ministère des armées, ont évidemment vocation à bénéficier des primes annoncées par le Premier ministre pour ceux qui se sont trouvés en première ligne.