S'agissant des indemnités, le culte bouddhiste a choisi de suivre la même organisation que les catholiques et les protestants. L'enveloppe donnée au culte est versée à certains aumôniers qui la reversent à leur tour à l'UBF dans sa totalité. Elle sert alors à financer l'organisation des formations et à rembourser les frais de mission. L'enveloppe ne suffit toutefois pas à couvrir la totalité des frais.