Les besoins de caractérisation dépendent des territoires. Dans certains territoires d'outre-mer, il est nécessaire de mieux caractériser les aquifères en termes de qualité chimique, sachant que les problématiques de quantité et de qualité de l'eau sont intrinsèquement liées. Nous connaissons les polluants que nous sommes susceptibles de retrouver, en particulier en Guadeloupe et en Martinique, mais nous rencontrons également des problèmes liés à l'assainissement. En effet, la défaillance des systèmes d'assainissement peut avoir des conséquences sur les aquifères côtiers.