En 2013, la Cour des comptes a rendu un rapport critique sur la mission de l'ONEMA de coordination technique des systèmes d'information sur l'eau, lui reprochant un manque de définition du rôle des différents intervenants, des défaillances dans le montage des banques et outils du SIE, un défaut de transparence dans la production et l'accès aux données, une insécurité juridique, un recours quasi systématique aux logiciels et licences propriétaires et une absence de maîtrise des informations géographiques. Quelles actions ont été menées depuis pour y remédier ?